Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms