Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms