Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FxnO35943 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FxnO35943 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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