Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Clk2O35491 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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