Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TnxbO35452 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms