Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms