Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms