Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21962L7N280 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms