Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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