Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21719J3KMI9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21719J3KMI9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21719J3KMI9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21719J3KMI9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21719J3KMI9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21719J3KMI9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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