Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm29394H3BIW7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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