Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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