Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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