Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm8005F6YKY3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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