Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms