Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms