Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms