Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde2E9PUP1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms