Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms