Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms