Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms