Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms