Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms