Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms