Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms