Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms