Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms