Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms