Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c4A2ANA3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms