Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lcn6A2AJB9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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