Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cldn13Q9Z0S4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cldn13Q9Z0S4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cldn13Q9Z0S4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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