Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Six6Q9QZ28 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Six6Q9QZ28 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Six6Q9QZ28 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Six6Q9QZ28 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Six6Q9QZ28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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