Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trpc5Q9QX29 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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