Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms