Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms