Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms