Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrn2Q9DBR1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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