Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ifi35Q9D8C4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms