Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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