Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins2Q9D600 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms