Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms