Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms