Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms