Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufs4Q9CXZ1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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