Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx10Q9CWT3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms