Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms