Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms