Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms