Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trappc5Q9CQA1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trappc5Q9CQA1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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