Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ankrd17Q99NH0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ankrd17Q99NH0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ankrd17Q99NH0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ankrd17Q99NH0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ankrd17Q99NH0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ankrd17Q99NH0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ankrd17Q99NH0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ankrd17Q99NH0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ankrd17Q99NH0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms